實驗室通風設計與舒適性空調系統的通風設計是有區別的。實驗室通風設計有實驗用的通風柜排風和室內平時排風兩種，通風柜排出實驗中產生的有害氣體(臭氣、濕氣以及易燃、易爆、腐蝕性氣體)。
通風柜的類別很多，包括中央實驗臺、邊臺、藥品柜、器皿柜等，這些通風柜是實驗室設備中最重要的設備。但它并不是室內唯一的排風裝置，實驗室還有平時排風口，布置在儀器室或產生危險物質的儀器上方。
設置原則：
1.分開排放
實驗室通風系統的設置原則是有毒、無毒分開排放，有機物、無機物分開排放。根據各實驗室的實際情況，每個實驗室排風系統基本是單獨設置的，少部分實驗室排風系統是同層相同功能房間的多臺并聯系統。
2.共用系統
實驗室通風柜排風與室內排風共用一套排風系統(風管及風機)。風機風速有三擋(或為變頻風機)，低速時為室內平時排風，中速時為通風柜排風，高速為室內平時排風加通風柜排風。風機設置在屋面，排風管為負壓，完全避免有害氣體在室內泄露。
各通風系統均配有排風補風系統。低速排風時的補風由室內人員新風補充。為避免大量抽用房間內空氣，造成能源的浪費
4.速度控制
對通風柜操作面的吸入風速進行控制，防止有害氣體逸出。對一般無毒的污染物風速控制為0.25~0.38m/s。對一般無毒的危險的有害物風速控制為0.4~0.5 m/s，劇毒或有少量放射性物質風速控制為0.5~0.6m/s。為了確保通風順暢，排風機應有必要的靜壓。另外，確定排風風速時還必須注意噪聲問題，通風管道內流速以5~8m/s為限。
5.排風變頻
一些有特殊排風要求的實驗室(例如有藥品柜、安全柜的實驗室)，其排風機配置變頻器，實現24小時不間斷排放。而一般實驗室房間排風均為負壓，壓差約5Pa。
6.防腐功能
有的通風柜內需要安置電爐，有的實驗產生的大量酸堿有害有毒氣體具有極強的腐蝕性，通風柜的臺面、襯板、側板都應具有防腐功能。使用硫酸、硝酸、氫氟酸等強酸的場合，還要求通風柜的整體材料必須防酸堿，須采用不銹鋼或玻璃鋼材料制造。風柜內襯板材質采用環氧樹脂板。
7.噪聲限值
實驗室的A聲級噪聲限制值為50dB，增加管道截面尺寸可以降低噪聲，考慮到管道的經費和施工問題，大部分風量為1600m3/h的通風柜與實驗室房間的管道、有平時排風要求的豎井的截面尺寸多數為350×400mm。
8.凈化處理
實驗室通風柜排出的有毒和酸堿腐蝕性極強的氣體會對環境造成污染，在排入大氣前根據氣體的成分采取吸取、過濾等措施對其進行凈化處理，使排出氣體有害成分低于國家環保衛生要求。
9.燃氣報警
對需要氫氣、乙炔和燃氣的實驗室，要作好房間內的通風。當實驗房間沒有可開啟外窗時還要設置燃氣泄漏報警裝置(防爆型)和事故排風(換氣次數為12 h-)，控制開關設在實驗室便于操作的地點。
10.能耗
整個實驗室雖然設置通風柜可能多達550臺以上。但資料和經驗表明100臺通風柜中99%的時間只有18個或更少的在使用，尤其是當實驗室不同時使用或放假期間，使用數量會更少，所以，不用擔心通風柜帶來巨大的能耗。
11.溫度
對豎向設置的發熱量較大的網絡機房設豎向集中排風，可有效控制服務器機房的溫度。
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